Като се направи наново, инсталира се .ZIP и ще се получи. На твое място бих инсталирал от папка
SuperUser файла SuperSU-1.41+Busybox-1.20.2.zip нищо, че е по-стария, заради това, че е заедно с BusyBox. След това той ще се ъпдейтне през Google Play до последната си версия.
Дано си сигурен, че става дума за SuperSU, защото горния файл е точно такъв. Различните superuser програми не са съвместими помежду си, и освен всичко, може да има само един работещ в системата.
Преди, ако съм имал проблем със скоростта на даването на root правата на програма, просто съм влизал в неговите Settings и съм превключвал да дава правата като "Allow", вместо "Prompt", т.е. да го прави без да пита.